F-111A 的平尾是全动式，没有升降舵。两个尾喷管间的后尾锥安装有放油口，这在航展中经常使用到，飞行员一边放油一边开加力，在机尾形成巨大的火焰，成为 F-111 的保留节目。
F-111A 有 6 个翼下挂架可挂载炸弹、火箭弹或副油箱。最外侧的一对挂架是固定式的不可旋转，通常情况下这两个挂架挂载外挂物时，机翼后掠角限制在 16~26 度之间变化。内侧的四个挂架安装了枢轴可顺气流旋转，在全部后掠范围内都可保持与中轴线的平行。F-111A 具有小型内置弹舱，可挂载两枚 340 千克的炸弹。弹舱内也可安装一门 20 毫米 M61A1 机炮及 2,000 发弹药。
在极端情况下，F-111A 可挂载多至 50 枚的 340 千克炸弹，弹舱两枚，剩余的挂载 6 个机翼挂架，或 26 枚 454 千克炸弹。但是在这种极限挂载状态下，机翼后掠角不得超过 26 度，并不适于实战。如果机翼需要后掠至 54 度，载弹量要减至 26 枚 340 千克炸弹。在美国空军标准程序中，根据航程的要求，F-111A 的可用载弹量在 3,600~9,000 千克间，例如任务航程 2,776 千米，那么最大载弹量是 7,200 千克。
APQ-113 前视攻击雷达是工作在 J 波段（16~16.4GHz）的大型液冷雷达，由驾驶舱右侧的系统军官操作，用于导航、空/地测距和武器投放。该雷达也有空空模式，可与 20 毫米机炮或响尾蛇导弹交联。
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RF-111A 是 F-111A 的战术侦察型，在弹舱内安装了侦察照相机的电子设备，1965 年 12 月 3 日正式立项。
一架预生产型 F-111A（63-9776）被改装成 RF-111A 原型机，于 1967 年 12 月 17 日首飞，1967 年 12 月~1968 年 10 月间该机进行了照相测试，成像质量相当不错，RF-111A 是架不错的侦察机。美国国防部希望在外场仅用几小时时间就能把 F-111A 改装成 RF-111A，并且往回改也简便易行。但是改装过程比期望的要复杂的多，需要花上几天而不是几小时，这个问题导致美国空军取消了整个 RF-111A 项目，这架原型机现在芒廷霍姆空军基地展出。
60 年代末 70 年代初，美国空军开始寻求道格拉斯 EB-66 电子战飞机的后继机，当时 EB-66 因在北越上空作战而机体迅速老化。
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EA-6B 是 4 座布局，如果把 F-111A 也改装成 4 座的话会大大减小内部载油量。解决办法是研制只需一名电子战军官操作，但与 EA-6B 功能相似的战术干扰系统。
1974 年 12 月位于长岛卡尔弗顿的格鲁曼飞机公司被选为改装项目的主承包商。1975 年 1 月 30 日格鲁曼获得了将两架 F-111A（66-0041 和 66-0049）改装成 EF-111A 原型机的合同，“E”表示“电子”。
改装内容包括安装一套 AN/ALQ-99 干扰系统，该系统的激励器、天线和其他设备安装在弹舱内的一个托架上，其他组件安装在机腹 4.88 米长的独木舟形天线罩内，垂尾顶部的短舱内容纳了电子对抗接收机。该机的自卫子系统包括一部干扰系统和一个干扰物投放装置。该机还安装了一套包括红外和电子对抗接收机在内的威胁接近警报子系统。垂尾经过加强以支撑顶部短舱。该机重新进行了电气布线，使用 90kVA 发电机替代了 60kVA 的型号，安装了用于电子设备散热的改进型环境控制系统。座舱被重新布置，右侧是全新的电子战军官座位，取消了原先的副驾驶操纵杆，导航仪表经过重新布置给左侧的飞行员使用，右侧还安装了电子战所需的控制杆和显示器。